1、秸秆还田之后，小麦常出现缺苗断垄，即使出了苗，根系扎在秸秆之中，出现苗黄苗弱。主要还是因为秸秆粉碎程度不够，翻到土壤之中，空隙大，不利于根系下扎。对于这种情况，要提高秸秆的粉碎程度。同时，在整地时，深耕能踏实土壤，有利于小麦出苗。

2、秸秆腐熟之后才能转化为养分，而这个过程需要肥料或者腐熟剂促进，和小麦争夺养分。所以，在施底肥时，要适当增施氮肥，促进秸秆腐熟，防止小麦因缺营养而发黄。另外，冬前浇越冬水，加入腐熟剂，也有利于秸秆的腐熟。

3、秸秆还田之后，土传病害和虫害增多，主要还是因为秸秆没有完全腐熟造成的。就像粪肥没有腐熟入田，加重病虫害的发生。在促进秸秆腐熟的基础上，应提高拌种质量，杜绝白籽播种，预防病虫害发生。

4、对于秸秆，一直没有一个好的出路。秋收之后，如果秸秆能有其它的用途当然是最好的。秸秆还田时，注意上面三个方面，提高土壤肥力，促进下茬作物的生长。