合作社注册商标的流程如下：

　　1、首先查询商标名称是否已有相同或相似商标存在，还需确认商标注册的类别，注册的商标所在的行业和服务。

　　2、接着准备材料：以个人名义提出申请，一般需要出示您的身份证及个体户营业执照的复印件。以企业名义来申请注册，需出示企业《营业执照》副本复印件以及盖有单位公章及个人签字的填写完整的商标注册申请书。

　　3、然后向国家知识产权局商标局，申请商标注册申请，或者委托商标代理机构委托商标代理机构，让他们帮你做商标申请文件，以及提交商标申请文件。

　　4、其次商标注册主管机关对商标注册申请，进行商标审查(9—12个月)、初审公告和注册公告(3个月)，公告无异议，就可以领取商标证。

　　5、最后关于注册商标额费用，1枚商标1次申请官费为300元，可以选择10个商品或服务类别，不足10个类别仍收取300元官费，超过10个类别超出部分按照30元/个类别收取官费。委托商标代理机构办理的，申请人应向商标代理机构缴纳商标注册证明官费和代理费。